王三郎學術成果豐碩，於2017年至2019年間發表42篇SCI國際學術論文、8件新發明專利（微生物及越南中草藥所生產糖尿病藥物開發）獲得核准（美國3件、日本2件、臺灣3件）。從1991年至今，已連續29年獲得國科會專題研究計畫以及研究獎勵，並出版《應用微生物學》及《生物技術》專書。

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